版納植物園樟科植物葉綠體比淳厚需要較基因組

文章来源:Erron 时间:2018-12-27

  版納植物園樟科植物葉綠體比淳厚需要較基因組研究獲進展

 

  樟科植物廣泛分佈於世界熱帶及亞熱帶地區,約有60屬、3500種 。樟科絕大多數種類為喬木,具有重要的林業資源價值和藥物開發使用潛力 。但是,当前對其開展林木遺傳學及比較基因組學的研讨依然非常无限。西雙版納熱帶植物園生物多樣性研讨組近期對該科兩個潤楠屬植物進行瞭葉綠體比較基因組學研讨,初次對樟科植物葉綠體基因組的基因和結構進行比較,定位突變位點,註釋根本基因功用,並篩選出可用於親緣進化關系剖析的高變區域。

  研讨人員以分佈於中國东北部高海拔地區的滇潤楠(Machilus yunnanensisLecomte)和越南北部低海拔地區的銹毛潤楠(Machilus balansae(Airy Shaw) F. N. Wei and S. C. Tang)為實驗原料,用138對引物對葉綠體基因組進行全覆蓋測序。通過比對發現,樟科潤楠屬植物的葉綠體基因組大小約為153 kb,近似於近緣科蠟梅科夏蠟梅屬植物;兩個潤楠葉綠體基因共有297個突變位點,突變率與中國人參各品系間的差異相當;其中包括231次替換事情、65次拔出缺失事情和一次位於ccsA-ndhD區的小倒位事情;95次替換事情發生在基因編碼區,标明具有進化選擇的能够性;36次缺失事情培养瞭可用於遺傳剖析的SSR位點;突變位點在葉綠體基因組上呈現非隨機性分佈,共有七個高集合區,極具系統剖析潛力但完全與傳統剖析序列差别 。

  研讨結果提醒瞭樟科植物葉綠體基因組的大小和結構;找到瞭先前應用於樟主場與開辟者隊交鋒時,火箭隊已不容有失  ,他們要全力爭勝科系統學研讨的葉綠體基因片段在種屬級別上缺乏分辨力的缘由,為後續該科的系統學研讨提供瞭无效的參考;同時也明確瞭樟科的一些大屬如潤楠屬存在種間遺傳差異小的事實。

  該研讨以Comparative analysis of complete chloroplast genome sequences of two tropical trees Machilusyunnanensis and Machilusbalansae in the family Lauraceae為題發表於Frontiers in Plant Science 雜志。

   文章鏈接

  

  

滇潤楠(Machilus yunnanensis

  

  

銹毛潤楠(Machilus balansae

  

  

葉綠體基因組